安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tracktables”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
方法来创建复杂的IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的HTML页面。
作者:汤姆·卡罗尔Sanjay Khadayate安妮Pajon,紫薇梁
维护人员:汤姆卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“tracktables”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tracktables”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tracktables”)
R脚本 | 创建与tracktables IGV HTML报告 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ReportWriting,测序,软件 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(3年) |
许可证 | GPL (> = 3) |
取决于 | R (> = 3.0.0) |
进口 | IRanges,GenomicRanges,XVector,Rsamtools,XML,tractor.base,stringr,RColorBrewer、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | tracktables_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | tracktables_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | tracktables_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/ |
包下载报告 | 下载数据 |