安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tracktables”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

tracktables

DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables

构建IGV追踪和HTML报告

Bioconductor版本:版本(3.5)

方法来创建复杂的IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的HTML页面。

作者:汤姆·卡罗尔Sanjay Khadayate安妮Pajon,紫薇梁

维护人员:汤姆卡罗尔< tc.infomatics gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“tracktables”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“tracktables”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tracktables”)

PDF R脚本 创建与tracktables IGV HTML报告
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ReportWriting,测序,软件
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(3年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (> = 3.0.0)
进口 IRanges,GenomicRanges,XVector,Rsamtools,XML,tractor.base,stringr,RColorBrewer、方法
链接
建议 knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 tracktables_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 tracktables_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) tracktables_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
包下载报告 下载数据

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支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网