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DOI:10.18129 / B9.bioc.trackViewer

一个极简设计的生物导体包，用于绘制优雅的轨道或棒棒糖情节

Bioconductor版本:Release (3.5)

可视化映射读取以及注释作为NGS数据集(如ChIP-seq, RNA-seq, miRNA-seq, DNA-seq, snp和甲基化数据)的跟踪层。

作者:欧建宏，王永旭，朱丽华

维护者:欧建宏<建宏。你在umassmed。edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	trackViewer装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.1.0)， grDevices，方法GenomicRanges、网格
进口	GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicFeatures，Gviz，pbapply，Rsamtools，rtracklayer，S4Vectors，尺度、工具、IRanges，AnnotationDbi，grImport
链接
建议	biomaRt，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，RUnit，org.Hs.eg.db，BiocGenerics，BiocStyle，knitr，VariantAnnotation
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	彗星
进口我	NADfinder
建议我	ATACseqQC，ChIPpeakAnno
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	trackViewer_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	trackViewer_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	trackViewer_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackViewer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trackViewer/
软件包下载报告	下载数据