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DOI:10.18129 / B9.bioc.tigre

转录因子通过高斯过程推理重建的表达

Bioconductor版本:版本(3.5)

tigre包实现了我们的方法的高斯过程的微分方程模型来分析基因表达时间序列从单一输入主题网络。包可以用于推断未被注意的转录因子(TF)蛋白质浓度测量已知目标基因的表达,或候选人排名目标特遣部队。

作者:Antti Honkela,裴高,Jonatan Ropponen, Miika-Petteri Matikainen,马格努斯寻求资助,尼尔·d·劳伦斯

维护人员:Antti Honkela <管理。在helsinki.fi honkela >

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PDF	R脚本	tigre快速指南
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PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,GeneRegulation,微阵列,NetworkInference,软件,TimeCourse,转录
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(7.5年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (> = 2.11.0),BiocGenerics,Biobase
进口	方法,AnnotationDbi,gplots、图形、grDevices统计,跑龙套,注释,DBI,RSQLite
链接
建议	drosgenome1.db,彪马,光民,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ahonkela/tigre
BugReports	https://github.com/ahonkela/tigre/issues
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进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tigre_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	tigre_1.30.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	tigre_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tigre
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tigre/
包下载报告	下载数据