要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
超六边形地图是一个巨大的六边形,在二维网格上无缝地由更小的六边形组成。它应该训练,分析和可视化高维组学输入数据。supraHex能够进行基因聚类/元聚类和样本相关,以及直观的可视化,以促进探索性分析。更重要的是,它允许将额外的数据叠加到经过训练的映射上,以探索输入和额外数据之间的关系。因此,使用supraHex,也可以进行多层组学数据比较。新增的实用工具是先进的热图可视化和基于树的样本关系分析。这个包的独特之处在于,用户可以快速地科学和艺术地理解任何表格组学数据,特别是在特定样本的方式下,但不会丢失大基因的信息。
作者:方海、朱利安·高夫
维护者:Hai Fang
引文(从R内,输入引用(“supraHex”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“supraHex”)
R脚本 | supraHex用户手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,GeneExpression,软件,可视化 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(4年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.3),hexbin |
进口 | 猿,质量, grDevices,图形,统计,utils |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://suprahex.r-forge.r-project.org |
全靠我 | |
进口我 | π |
建议我 | TCGAbiolinks |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | supraHex_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | supraHex_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | supraHex_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/supraHex |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/supraHex/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |