要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

supraHex

DOI:10.18129 / B9.bioc.supraHex

supraHex:用于分析表格组学数据的超六角形图

Bioconductor版本:Release (3.5)

超六边形地图是一个巨大的六边形,在二维网格上无缝地由更小的六边形组成。它应该训练,分析和可视化高维组学输入数据。supraHex能够进行基因聚类/元聚类和样本相关,以及直观的可视化,以促进探索性分析。更重要的是,它允许将额外的数据叠加到经过训练的映射上,以探索输入和额外数据之间的关系。因此,使用supraHex,也可以进行多层组学数据比较。新增的实用工具是先进的热图可视化和基于树的样本关系分析。这个包的独特之处在于,用户可以快速地科学和艺术地理解任何表格组学数据,特别是在特定样本的方式下,但不会丢失大基因的信息。

作者:方海、朱利安·高夫

维护者:Hai Fang

引文(从R内,输入引用(“supraHex”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“supraHex”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“supraHex”)

PDF R脚本 supraHex用户手册
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件可视化
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.3),hexbin
进口 质量, grDevices,图形,统计,utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://suprahex.r-forge.r-project.org
全靠我
进口我 π
建议我 TCGAbiolinks
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 supraHex_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 supraHex_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) supraHex_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/supraHex
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/supraHex/
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