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splineTimeR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.splineTimeR
时间进程差异基因表达数据分析使用样条回归模型基因协会网络重建紧随其后
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包提供了功能基因表达差异基因表达分析的时间进程的数据。自然三次样条回归模型。识别基因可能会进一步被用于通路富集分析和/或时间的重建协会相关的基因调控网络。
作者:Agata Michna
维护人员:赫伯特Braselmann < braselm在helmholtz-muenchen.de >
从内部引用(R,回车引用(“splineTimeR”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“splineTimeR”)
文档
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| R脚本 | splineTimeR | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,NetworkEnrichment,NetworkInference,回归,软件,TimeCourse |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3),Biobase,igraph,limma,GSEABase,gtools样条函数,GeneNet(> = 1.2.13),纵向(> = 1.1.12),金融中间人 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | splineTimeR_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | splineTimeR_1.4.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | splineTimeR_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splineTimeR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/splineTimeR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
