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DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceSites

bioconductor包的探索从RNA-seq数据对齐间隙位置

Bioconductor版本:版本(3.5)

执行拼接RNA-seq集中分析数据。

作者:沃尔夫冈·凯瑟

维护者:沃尔夫冈·凯瑟在med.uni-duesseldorf.de > <凯撒

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PDF	R脚本	spliceSites
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,蛋白质组学,RNAseq,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,rbamtools(> = 2.14.3),refGenome(> = 1.6.0),Biobase,Biostrings(> = 2.28.0)
进口	BiocGenerics,杜比环绕声系统,seqLogo,IRanges
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	spliceSites_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	spliceSites_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	spliceSites_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spliceSites/
包下载报告	下载数据