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DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceR

来自RNA-seq数据的可选剪接分类和编码潜力预测。

Bioconductor版本:Release (3.5)

一个用于从RNA-seq数据中分类备选剪接和预测编码潜力的R包。

作者:Johannes Waage < Johannes。工资在gmail.com>， Kristoffer Vitting-Seerup 上浇浇

维护者:Johannes Waage < Johannes。工资在gmail.com>， Kristoffer Vitting-Seerup 上浇浇

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

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PDF	R脚本	连接工具装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，测序，软件，转录，可视化
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.15.0)，方法，腰带，rtracklayer，维恩图，RColorBrewer，plyr
进口	GenomicRanges，IRanges
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	spliceR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	spliceR_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	spliceR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spliceR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spliceR/
软件包下载报告	下载数据