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snpStats
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DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats
SnpMatrix XSnpMatrix类和方法
Bioconductor版本:版本(3.5)
类和统计方法对大型SNP研究协会。这扩展了早些时候snpMatrix包,允许基因型的不确定性。
作者:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >
维修工:大卫·克莱顿< dc208在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“snpStats”)):
安装
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browseVignettes (“snpStats”)
| R脚本 | 数据输入 | |
| R脚本 | 置 | |
| R脚本 | 归责和荟萃分析 | |
| R脚本 | LD统计 | |
| R脚本 | 主成分分析 | |
| snpMatrix-differences | ||
| R脚本 | snpStats介绍 | |
| R脚本 | TDT)测试 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GeneticVariability,微阵列,单核苷酸多态性,软件 |
| 版本 | 1.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(6.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10.0),生存,矩阵、方法 |
| 进口 | 图形、grDevices统计,跑龙套,BiocGenerics,zlibbioc |
| 链接 | |
| 建议 | hexbin |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | GGBase,GGdata |
| 进口我 | FunciSNP,GeneGeneInteR,GGtools,gQTLstats,gwascat,ldblock,餐 |
| 建议我 | crlmm,GWASTools,VariantAnnotation |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | snpStats_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | snpStats_1.26.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | snpStats_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
