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DOI:10.18129 / B9.bioc.seqTools

fastq文件的核苷酸、序列和质量内容分析

Bioconductor版本:Release (3.5)

分析未压缩和压缩fastq文件的读取长度，phred分数和字母频率和DNA k-mers。

作者:沃尔夫冈·凯泽斯

维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>

安装

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文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“seqTools”)

PDF	R脚本	简介
PDF	R脚本	seqTools_qual_report
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	质量控制，测序，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(三年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,跑龙套,zlibbioc
进口
链接	zlibbioc
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	seqTools_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	seqTools_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	seqTools_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqTools/
软件包下载报告	下载数据