要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqPattern”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
可视化寡核苷酸模式和序列基序出现在一个公共参考点中心的大序列集,并根据用户定义的特征进行排序。
作者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>
维护者:Vanja Haberle < Vanja。Haberle在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“seqPattern”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“seqPattern”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“seqPattern”)
R脚本 | seqPattern | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | SequenceMatching,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.15.0) |
进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix |
链接 | |
建议 | BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,篮球选手,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | genomation |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | seqPattern_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqPattern_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | seqPattern_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqPattern |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqPattern/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |