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DOI:10.18129 / B9.bioc.seqLogo

DNA序列比对的序列标识

Bioconductor版本:版本(3.5)

seqLogo需要位置权重矩阵的一个DNA序列的主题和情节的相应序列标识引入施耐德和史蒂芬斯(1990)。

作者:奥利弗Bembom

维护人员:奥利弗Bembom <奥利弗。在gmail.com bembom >

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PDF	R脚本	DNA序列比对的序列标识
PDF		参考手册

细节

biocViews	SequenceMatching,软件
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(10.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	方法、网格
进口	stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	motifRG,rGADEM
进口我	感兴趣,motifRG,PWMEnrich,rGADEM,riboSeqR,spliceSites,分裂,TFBSTools
建议我	BCRANK,DiffLogo,Logolas,motifcounter,MotifDb
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	seqLogo_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	seqLogo_1.42.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	seqLogo_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqLogo
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/seqLogo/
包下载报告	下载数据