要安装此软件包,请启动R并输入:
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生物导体版本:版本(3.5)
实施单细胞RNA-seq数据的各种低级分析。提供了用于细胞特异性偏差,细胞周期阶段分配以及检测高度可变和显着相关基因的方法。
作者:Aaron Lun [AUT,CRE],Karsten Bach [AUT],Jong Kyoung Kim [CTB],Antonio Scialdone [CTB],Laleh Haghverdi [CTB]
维护者:aaron lun
引用(从r内,输入引用(“ scran”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
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html | R脚本 | 使用SCAN对单细胞RNA-seq数据进行基本分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 批处理效应,,,,基因表达,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学,,,,可视化 |
版本 | 1.4.5 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.4),生物比较,,,,评分 |
进口 | 生物酶,统计,方法,utils,图形,grdevices,矩阵,,,,EDGER,,,,林玛,,,,DynamiCtreCut,,,,fnn,,,,Igraph,,,,闪亮的,,,,动物园,,,,Statmod,花键,GGPLOT2,,,,大量的,,,,DT,,,,维里迪斯 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,limsolve,,,,org.mm.eg.db,,,,deseq2,,,,单片,,,,S4VECTORS,,,,RTSNE,,,,pracma |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | SCDD,,,,烤饼 |
建议我 | 飞溅 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | scran_1.4.5.tar.gz |
Windows二进制 | scran_1.4.5.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | scran_1.4.5.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scran |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scran/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |