要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“烤饼”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

DOI:10.18129 / b9.bioc.scone.

标准化表达数据的单个单元格概述

Bioconductor版本:释放(3.5)

烤饼是用于比较和排名单细胞RNA-SEQ和其他高通量分析的不同归一化方案的性能的R包。

作者:Michael Cole [Aut,Cre,Cph],Davide Risso [Aut,CPH]

维护者:Michael Cole

引文(从R内,输入引文(“烤饼”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“烤饼”)

文件

HTML. r script. 斯克隆的小插图
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 覆盖范围基因表达正常化预处理QualityControl.rnaseq.测序SingleCell.软件转录组学
版本 1.0.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.5(R-3.4)(0.5岁)
执照 艺术-2.0
依靠 R(> = 3.4),方法,概括分析
进口 图形,统计数据,Util,Aroma.Light.生物相投班级组合物diptest.edaseq.edger.FPC.贡献,grdevices,六己林马MatrixStats.mixtools.rcolorbrewer.靴子闪亮的miniui.RHDF5.Ruvseq.DT.NMF.ggplot2.情节重塑2.visnetwork.rarpack.
链接到
建议 生物焦scrnapeq.knRAMAMAMDOW.testthat.
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URL.
Bugreports. https://github.com/yoseflab/scone/issues.
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源包 scone_1.0.0.tar.gz.
Windows二进制文件 scone_1.0.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) scone_1.0.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/scone.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/scone/
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