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DOI:10.18129 / B9.bioc.roar

从RNA-seq比对确定微分APA使用

Bioconductor版本:版本(3.5)

确定优先使用APA网站,比较两个生物条件,从已知的替代标准RNA-seq试验得到网站和比对。

作者:埃琳娜格拉希

维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >

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PDF	R脚本	从RNA-seq比对确定微分APA使用
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文本		新闻

细节

biocViews	HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.1)
进口	方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer,GenomeInfoDb
链接
建议	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/vodkatad/roar/
取决于我
进口我	XBSeq
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	roar_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	roar_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	roar_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/roar/
包下载报告	下载数据