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DOI:10.18129 / B9.bioc.rhdf5

R HDF5接口

Bioconductor版本:版本(3.5)

这个R / Bioconductor包提供了一个接口HDF5和R . HDF5之间的主要功能是存储和访问的能力非常大的和/或复杂的数据集和各种元数据海量存储器(磁盘)通过一个完全可移植文件格式。rhdf5包是适合大型和/或复杂的交换数据集之间的R和其他软件包,让R应用工作大于可用内存的数据集。

作者:贝恩德•菲舍尔,格雷戈勒加索尔

维护人员:迈克史密斯<迈克。史密斯在embl.de >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“rhdf5”)

PDF	R脚本	rhdf5
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,软件
版本	2.20.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 12.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法
进口	zlibbioc
链接
建议	bit64,BiocStyle
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
取决于我	GENE.E,GSCA,HDF5Array
进口我	biomformat,diffHic,DmelSGI,DOQTL,GENE.E,h5vc,电离,嘘,司康饼
建议我	SummarizedExperiment,tximport
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rhdf5_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	rhdf5_2.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	rhdf5_2.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
包下载报告	下载数据