要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rfpred”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

rfpred

doi:10.18129/b9.bioc.rfpred

将RFPRED功能预测分数分配给错义变体列表

生物导体版本:版本(3.5)

基于众多数据文件,将RFPred分数预先计算在人类外显子组的所有基因组位置上,该软件包将RFPRED分数提供给了由染色体确定的错义变体,位置(HG19版本),指称和替代核苷酸以及Uniprots和Uniprots蛋白质的标识符。请注意,对于使用软件包,必须在Internet上连接用户或下载TabixFile和索引(大约3.3 GO)。

作者:Fabienne Jabot-Hanin,Hugo Varet和Jean-Philippe Jais

维护者:雨果Varet

引用(从r内,输入引用(“ rfpred”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rfpred”)

文档

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browsevignettes(“ rfpred”)

PDF R脚本 calculatingrfpredscoreswithpackagerfpred
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,分类,,,,软件
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(4年)
执照 GPL(> = 2)
要看 rsamtools,,,,基因组机,,,,iranges,,,,Data.Table,方法,并行
进口
链接
建议 生物使用
系统要求
增强
URL http://www.sbim.fr/rfpred
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 RFPRED_1.14.0.TAR.GZ
Windows二进制 RFPRED_1.14.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) RFPRED_1.14.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfpred
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rfpred/
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