要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rgadem”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

rgadem

doi:10.18129/b9.bioc.rgadem

从头图案发现

生物导体版本:版本(3.5)

RGADEM是用于大规模基因组序列数据的Noknot Motif Discovery工具。这是一个开源R软件包,基于GADEM软件。

作者:Arnaud Droit,Raphael Gottardo,Gordon Robertson和Leiping Li

维护者:arnaud droit

引用(从r内,输入引用(“ rgadem”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ rgadem”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ rgadem”)

PDF R脚本 RGADEM用户指南
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,芯片,,,,微阵列,,,,主题,,,,测序,,,,软件
版本 2.24.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(7。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.11.0),生物弦,,,,iranges,,,,BSGENOME, 方法,seqlogo
进口 生物弦,,,,iranges,方法,图形,seqlogo
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 动机
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rgadem_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 rgadem_2.24.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) rgadem_2.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgadem
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rgadem/
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