要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“rbiopaxparser”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:释放(3.5)
解析Biopax文件并表示在R中,在瞬间Biopax级别2和级别3。
作者:弗兰克克莱默
维护者:Frank Kramer
引文(从R内,输入引文(“rbiopaxparser”)
):
要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“rbiopaxparser”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“RBIOPAXPARSER”)
PDF. | r script. | rbiopaxparser小插图 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | datarepresentation.那软件 |
版本 | 2.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.12(R-3.0)(4.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 3.0.0),data.table. |
进口 | XML. |
链接到 | |
建议 | rghrachviz那rcurl.那图形那运行那生物根系那NEM.那RBGL.那iGraph. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://github.com/frankkramer-lab/rbiopaxparser. |
取决于我 | |
进口我 | annotationhubdata.那粉末 |
建议我 | annotationhub.那NetPathminer. |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | rbiopaxparser_2.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | rbiopaxparser_2.16.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | RBIOPAXPARSER_2.16.0.TGZ. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/rbiopaxparser. |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/rbiopaxparser/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |