要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“r3Cseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

r3Cseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.r3Cseq

染色体构象捕获分析和下一代测序(3C-seq)

Bioconductor版本:Release (3.5)

该软件包是3C-seq分析远程相互作用数据分析的实现。

作者:Supat Thongjuea, MRC分子血液学单元,Weatherall分子医学研究所,牛津大学,英国< Supat。Thongjuea在ndcls.ox.ac.uk>

维护者:Supat Thongjuea < Supat。Thongjuea在ndcls.ox.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“r3Cseq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“r3Cseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“r3Cseq”)

PDF R脚本 r3Cseq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 预处理测序软件
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 GenomicRangesRsamtoolsrtracklayerVGAMqvalue
进口 方法,GenomeInfoDbIRangesBiostringsdata.tablesqldfRColorBrewer
链接
建议 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.maskedBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.maskedBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.maskedBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.maskedBSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked
SystemRequirements
增强了
URL http://r3cseq.genereg.net
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 r3Cseq_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 r3Cseq_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) r3Cseq_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3Cseq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/r3Cseq/
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文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网