##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“r3Cseq”)

DOI:10.18129 / B9.bioc.r3Cseq

染色体构象捕获分析和下一代测序(3C-seq)

Bioconductor版本:Release (3.5)

该软件包是3C-seq分析远程相互作用数据分析的实现。

作者:Supat Thongjuea, MRC分子血液学单元，Weatherall分子医学研究所，牛津大学，英国< Supat。Thongjuea在ndcls.ox.ac.uk>

维护者:Supat Thongjuea < Supat。Thongjuea在ndcls.ox.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“r3Cseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“r3Cseq”)

PDF	R脚本	r3Cseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	预处理，测序，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	GenomicRanges，Rsamtools，rtracklayer，VGAM，qvalue
进口	方法,GenomeInfoDb，IRanges，Biostrings，data.table，sqldf，RColorBrewer
链接
建议	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked，BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked
SystemRequirements
增强了
URL	http://r3cseq.genereg.net
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	r3Cseq_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	r3Cseq_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	r3Cseq_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3Cseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/r3Cseq/
软件包下载报告	下载数据