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quantro

DOI:10.18129 / B9.bioc.quantro

测试时使用分位数正常化

Bioconductor版本:版本(3.5)

一个数据驱动测试的假设分位数正常化使用对象继承eset等原始数据(例如ExpressionSet, MethylSet)。组级别每个样本的信息(如肿瘤/正常状态)也必须提供,因为测试评估如果有全球用户定义的组间的分布差异。

作者:斯蒂芬妮·伊瑞希克斯和拉斐尔

维护人员:斯蒂芬妮·希克斯<醉的jimmy.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“quantro”)):

安装

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PDF R脚本 quantro用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,测序,软件
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(3年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (> = 3.1.3)
进口 Biobase,minfi,doParallel,foreach,迭代器,ggplot2、方法、RColorBrewer
链接
建议 knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
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包档案

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源包 quantro_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 quantro_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) quantro_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/
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