要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pqsfinder”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
生物导体版本:版本(3.5)
该软件包的主要功能是检测可能折叠成分子内G-四链体(G4)的DNA序列模式。与许多其他方法不同,该软件包能够检测到负责从包含凸起或不匹配的G4折叠的G4的序列,因此比竞争算法更敏感。
作者:Jiri Hon,Matej Lexa和Tomas Martinek
维护者:jiri hon
引用(从r内,输入引用(“ pqsfinder”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pqsfinder”)
html | R脚本 | PQSFinder:用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 结肠管制,,,,主题,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.9 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(1。5年) |
执照 | BSD_2_Clause +文件许可证 |
要看 | 生物弦 |
进口 | RCPP(> = 0.12.3),基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS, 方法 |
链接 | RCPP,,,,BH(> = 1.62.0) |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,GVIZ,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,测试 |
系统要求 | GNU MAKE,C ++ 11 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pqsfinder_1.4.9.tar.gz |
Windows二进制 | pqsfinder_1.4.9.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | pqsfinder_1.4.9.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pqsfinder |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pqsfinder/ |
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