要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pqsfinder”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

PQSFINDER

doi:10.18129/b9.bioc.pqsfinder

识别潜在四链体形成序列

生物导体版本:版本(3.5)

该软件包的主要功能是检测可能折叠成分子内G-四链体(G4)的DNA序列模式。与许多其他方法不同,该软件包能够检测到负责从包含凸起或不匹配的G4折叠的G4的序列,因此比竞争算法更敏感。

作者:Jiri Hon,Matej Lexa和Tomas Martinek

维护者:jiri hon

引用(从r内,输入引用(“ pqsfinder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pqsfinder”)

文档

html R脚本 PQSFinder:用户指南
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结肠管制,,,,主题,,,,测序,,,,软件
版本 1.4.9
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(1。5年)
执照 BSD_2_Clause +文件许可证
要看 生物弦
进口 RCPP(> = 0.12.3),基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS, 方法
链接 RCPP,,,,BH(> = 1.62.0)
建议 生物使用,,,,尼特,,,,GVIZ,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,测试
系统要求 GNU MAKE,C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pqsfinder_1.4.9.tar.gz
Windows二进制 pqsfinder_1.4.9.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) pqsfinder_1.4.9.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pqsfinder
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pqsfinder/
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