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doi：10.18129/b9.bioc.pcaexplorer

使用主要组件方法对RNA-SEQ数据进行交互式可视化

生物导体版本：版本（3.5）

该软件包提供了基于主组件分析的RNA-Seq数据集的交互式可视化功能。提供的方法可以快速提取信息和有效的数据探索。闪亮的应用程序封装了整个分析。

作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]

维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

html	R脚本	PCAExplorer用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	维度，，，，GUI，，，，委托人，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，软件，，，，可视化
版本	2.2.1
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（1。5年）
执照	麻省理工学院 +文件许可证
要看
进口	deseq2，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GeneFilter，，，，GGPLOT2（> = 2.0.0），D3 -HeatMap，，，，秤，，，，NMF，，，，plyr，，，，topgo，，，，林玛，，，，gostats，，，，go.db，，，，AnnotationDbi，，，，闪亮的（> = 0.12.0），发光的dashboard，，，，丝绸，，，，Ggrepel，，，，DT，，，，闪亮，，，，三j，，，，Biomart，，，，pheatmap，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，花花公子，grdevices，方法
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，呼吸道，，，，org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL	https://github.com/federicomarini/pcaexplorer
BugReports	https://github.com/federicomarini/pcaexplorer/issues
取决于我
进口我	理想的
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	pcaexplorer_2.2.1.tar.gz
Windows二进制	pcaexplorer_2.2.1.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	pcaexplorer_2.2.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaexplorer
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/pcaexplorer/
软件包下载报告	下载统计