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pRoloc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.pRoloc
空间蛋白质组学统一的生物信息学框架
Bioconductor版本:Release (3.5)
该软件包实现了定量质谱数据的模式识别技术，以推断蛋白质亚细胞定位。
作者:劳伦特·盖托和丽莎·m·布雷克尔斯，托马斯·伯格和塞缪尔·维佐雷克撰稿
维护者:Laurent Gatto
引文(从R内，输入引用(“pRoloc”))：
安装
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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“pRoloc”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“pRoloc”)
| R脚本 | 空间蛋白质组学的迁移学习算法 | |
| R脚本 | HUPO 2011海报:pRoloc——统一的细胞器蛋白质组学生物信息学框架 | |
| R脚本 | HUPO 2014海报:用于空间蛋白质组学数据分析的最先进的机器学习管道 | |
| pRoloc中提供的机器学习技术 | ||
| pRoloc教程 | ||
| 超文本标记语言 | R脚本 | 注释空间蛋白质组数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 视频 | pRoloc, pRolocdata和pRolocGUI |
细节
| biocViews | 分类，聚类，MassSpectrometry，蛋白质组学，质量控制，软件 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 2.15)，MSnbase(> = 1.19.20),MLInterfaces(>= 1.37.1)，方法Rcpp(> = 0.10.3),BiocParallel |
| 进口 | Biobase，mclust(> = 4.3),脱字符号，e1071，抽样，类，kernlab，晶格，nnet，randomForest，代理，模糊神经网络，hexbin，BiocGenerics统计数据,dendextend，RColorBrewer，尺度，质量，knitr，mvtnorm，gtools，plyr，ggplot2，biomaRt， utils, grDevices，图形 |
| 链接 | Rcpp，RcppArmadillo |
| 建议 | testthat，rmarkdown，pRolocdata(> = 1.9.4),roxygen2，synapter，xtable，Rtsne，rgl，BiocStyle，hpar(> = 1.15.3),dplyr，GO.db，AnnotationDbi |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lgatto/pRoloc |
| BugReports | https://github.com/lgatto/pRoloc/issues |
| 全靠我 | pRolocGUI |
| 进口我 | |
| 建议我 | MSnbase，pRolocdata，RforProteomics |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | pRoloc_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | pRoloc_1.16.1.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | pRoloc_1.16.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pRoloc |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pRoloc/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
