要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“openCyto”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

用于流式细胞仪数据的分层门控管道

Bioconductor版本:Release (3.5)

该包的设计是为了方便自动门控方法以顺序方式模拟手动门控策略。

作者:Mike Jiang, John Ramey, Greg Finak, Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang

引文(从R内,输入引用(“openCyto”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“openCyto”)

文档

超文本标记语言 R脚本 openCyto包简介
超文本标记语言 R脚本 如何使用不同的自动门控功能
超文本标记语言 R脚本 如何写一个csv门控模板
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometry预处理软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 flowWorkspace(> = 3.17.43)
进口 方法,BiobasegtoolsflowCore(> = 1.31.17),flowVizncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspaceflowStats(> = 3.29.1),flowClust(> = 3.11.4),质量线索plyrRBGLdata.tableksRColorBrewer晶格rrcovR.utils
链接 Rcpp
建议 flowWorkspaceDataknitrtestthat, utils,工具,并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 CytoML
建议我 flowCoreggcyto
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 openCyto_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 openCyto_1.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) openCyto_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/openCyto/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网