要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“oligoclasses”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

oligoclasses.

DOI:10.18129 / b9.bioc.oligoclasses.

Oligo和CRLMM支持的高吞吐量阵列的课程

Bioconductor版本:释放(3.5)

此程序包包含Oligo和CRLMM包使用的类的类定义,有效性检查和初始化方法。

作者:Benilton Carvalho和Robert Scharpf

维护者:Benilton Carvalho robert scharpf

引文(从R内,输入引文(“oligoclasses”)):

安装

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文件

PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 基础设施软件
版本 1.38.0
在生物导体中以来 BIOC 2.1(R-2.6)(10年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 2.14)
进口 生物根系(> = 0.3.2),BioBase.(> = 2.17.8),方法,图形,绞喉(> = 2.5.17),Genomicranges.(> = 1.23.7),概括分析生物仪器(> = 2.23.6),挚友(> = 1.23.2),FF.Foreach.生物粘合剂,实用,S4Vectors.(> = 0.9.25),rsqlite.
链接到
建议 hapmapsnp5.hapmapsnp6.pd.genomewidesnp.6.pd.genomewidesnp.5pd.mapping50k.hind240pd.mapping50k.xba240pd.mapping250k.sty.pd.mapping250k.nsp.nsp.Genomewidesnp6crlmm.(> = 1.0.7),Genomewidesnp5crlmm.(> = 1.0.6),运行human370v1ccrlmm.SNPCHIP.香草CRLMM.
系统要求
加强 domc.dompi.Dosnow.多达齐全无聊
URL.
取决于我 cn.farms.CRLMM.MBPCR.oligo.pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1.pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter.pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter.pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter.pd.ag.pd.aragene.1.0.st.pd.aragene.1.1.st.st.pd.atdschip.tiling.pd.ath1.121501.PD.Barley1.pd.bovgene.1.0.st.st.pd.bovgene.1.1.st.st.st.Pd.bovine.pd.bsubtilis.pd.cangeene.1.0.st.st.pd.cangeene.1.1.st.st.Pd.Canine.pd.canine.2pd.celegans.pd.charm.hg18.example.pd.chicken.pd.chigene.1.0.stpd.chigene.1.1.st.st.pd.chogene.2.0.st.pd.chogene.2.1.stPd.Citrus.pd.clariom.d.human.pd.clariom.s.human.pd.clariom.s.human.ht.pd.clariom.s.mouse.pd.clariom.s.mouse.ht.pd.clariom.s.rat.pd.clariom.s.rat.ht.PD.COTTON.pd.cyngene.1.0.st.st.pd.cyngene.1.1.st.st.Pd.cygene.1.0.st.Pd.cygene.1.1.st.st.pd.cytogenetics.Array.pd.drogene.1.0.st.st.pd.drogene.1.1.st.st.pd.drosgenome1.pd.drosophila.2pd.e.coli.2.pd.ecoli.pd.ecoli.asv2.pd.elegene.1.0.stpd.elegene.1.1.st.st.st.pd.equgene.1.0.st.st.pd.equgeNe.1.1.st.st.pd.feinberg.hg18.me.hx1.pd.feinberg.mm8.me.hx1.pd.felgene.1.0.st.pd.felgene.1.1.st.st.st.Pd.fingene.1.0.st.st.pd.fingene.1.1.1.st.st.pd.genomewidesnp.5pd.genomewidesnp.6.pd.guigene.1.0.st.pd.guigene.1.1.st.st.pd.hc.g110.pd.hg.focus.pd.hg.u133.plus.2pd.hg.u133a.pd.hg.u133a.2pd.hg.u133a.tag.pd.hg.u133b.pd.hg.u219.pd.hg.u95a.pd.hg.u95av2.pd.hg.u95b.pd.hg.u95c.pd.hg.u95d.pd.hg.u95e.pd.hg18.60mer.expr.pd.ht.hg.u133.plus.pm.pd.ht.hg.u133a.pd.ht.mg.430Apd.hta.2.0.pd.hu6800.pd.huex.1.0.st.v2.pd.hugene.1.0.st.v1pd.hugene.1.1.st.v1pd.hugene.2.0.st.pd.hugene.2.1.st.st.pd.maize.pd.mapping250k.nsp.nsp.pd.mapping250k.sty.pd.mapping50k.hind240pd.mapping50k.xba240pd.margene.1.0.st.st.pd.margene.1.1.st.st.Pd.Medgene.1.0.st.Pd.Medgene.1.1.st.st.Pd.Medicago.pd.mg.u74a.pd.mg.u74av2.pd.mg.u74b.pd.mg.u74bv2.pd.mg.u74c.pd.mg.u74cv2.pd.mirna.1.0pd.mirna.2.0pd.mirna.3.0.pd.mirna.3.1.pd.mirna.4.0.pd.moe430apd.moe430b.pd.moex.1.0.st.v1pd.mogene.1.0.st.v1pd.mogene.1.1.st.v1pd.mogene.2.0.st.pd.mogene.2.1.st.st.pd.mouse430.2pd.mouse430a.2pd.mta.1.0.pd.mu11ksuba.pd.mu11ksubb.pd.nugo.hs1a520180.pd.nugo.mm1a520177pd.ovigene.1.0.st.st.pd.ovigene.1.1.st.st.st.pd.pae.g1a.pd.plasmodium.anopheles.pd.poplar.pd.portcine.pd.porgene.1.0.st.st.Pd.porgene.1.1.st.st.pd.rabgene.1.0.stpd.rabgene.1.1.st.st.pd.rae230a.pd.rae230b.pd.raex.1.0.st.v1.pd.ragene.1.0.st.v1pd.ragene.1.1.st.v1pd.ragene.2.0.st.pd.ragene.2.1.st.st.pd.rat230.2pd.rcngene.1.0.st.st.pd.rcngene.1.1.st.st.st.pd.rg.u34a.pd.rg.u34b.pd.rg.u34c.pd.rhegene.1.0.st.st.pd.rhegene.1.1.st.st.PD.RESUSpd.rice.pd.rjpgene.1.0.st.st.pd.rjpgene.1.1.st.st.pd.rn.u34.pd.rta.1.0.pd.rusgene.1.0.st.st.pd.rusgene.1.1.st.st.pd.s.aureus.Pd.soybean.Pd.soygene.1.0.st.st.pd.soygene.1.1.st.st.pd.sugar.cane.pd.tomato.pd.u133.x3p.pd.vitis.vinifera.pd.kwheat.pd.x.laevis.2pd.x.tropicalis.pd.xenopus.laevis.pd.yest.2.pd.yg.s98.pd.zebgene.1.0.st.st.pd.zebgene.1.1.st.st.st.pd.czebrafish.彪马挥舞车
进口我 倍感工具arraytv.魅力frma.斜斜体mimager.最小值pdinfobuilder.彪马SNPCHIP.香草
建议我 生物根系CNPBAYES.hapmapsnp6.
建立报告

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源包 oligoclasses_1.38.0.tar.gz.
Windows二进制文件 oligoclasses_1.38.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) oligoclasses_1.38.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/Oligoclasses.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/oligoclasses/
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