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MVGST.

DOI:10.18129 / b9.bioc.mvgst.

多变量和定向基因设置测试

Bioconductor版本:释放(3.5)

MVGST提供独立于平台的工具,以识别差异的差异(上或向下)的GO术语(基因集)以多重的感兴趣对比度。给定单侧p值的矩阵(基因的行,对比度的柱),MVGST使用Meta-Dialtic方法将所有基因的P值与每个基因集合的所有基因组合,然后将每个基因分类为显着分类活性(1),较少的活性(-1),或者在每个感兴趣的对比中或没有显着差异差异(0)。随着感兴趣的多重对比,每个基因集被分配给差异活动的概况(横跨对比度)。还提供了用于可视化(在GO图表中)的工具,该基因集分类为给定的配置文件。

作者:John R. Stevens和Dennis S. Mecham

维护者:John R. Stevens

引文(从R内,输入引文(“MVGST”)):

安装

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文本 消息

细节

Biocviews. 不同的亚兴GenesetenRichment.graphandnetwork.微阵列oneChannel.途径rnaseq.软件
版本 1.10.0
在生物导体中以来 BIOC 3.0(R-3.1)(3年)
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源包 mvgst_1.10.0.tar.gz.
Windows二进制文件 mvgst_1.10.0.zip.
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源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/mvgst.
包短网址 http://biocidodder.org/packages/mvgst/
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