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DOI:10.18129 / B9.bioc.msgbsR

msgbsR:甲基化敏感的基因测序(MS-GBS) R功能

Bioconductor版本:版本(3.5)

管道的分析MS-GBS实验。

作者:本杰明·梅恩

维修工:本杰明·梅恩<本杰明。梅恩在adelaide.edu.au >

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PDF	R脚本	msgbsR_Example
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,MethylSeq,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),GenomicRanges、方法
进口	BSgenome,easyRNASeq,刨边机,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,ggbio,ggplot2,IRanges平行,plyr,Rsamtools,R.utils统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors,跑龙套
链接
建议	roxygen2,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	msgbsR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	msgbsR_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	msgbsR_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/
包下载报告	下载数据