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DOI:10.18129 / B9.bioc.methyAnalysis

DNA甲基化数据分析和可视化

Bioconductor版本:版本(3.5)

methyAnalysis包DNA甲基化数据分析和可视化的目的。MethyGenoSet类定义保持染色体的位置信息和数据。的包还包括功能从Methy-Seq数据估算的甲基化水平。

作者:杜潘,理查德Bourgon

维护人员:杜潘< dupan。邮件在gmail.com >, Lei黄< lhuang bsd.uchicago.edu >,帮派冯< g-feng northwestern.edu >

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PDF	R脚本	介绍methyAnalysis包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation,微阵列,软件,可视化
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10),网格,BiocGenerics,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,Biobase(> = 2.34.0),org.Hs.eg.db
进口	统计,grDevices跑龙套,光民,methylumi,Gviz,genoset,SummarizedExperiment,IRanges,GenomicRanges,VariantAnnotation,rtracklayer,GenomicFeatures,注释,Biobase(> = 2.5.5),AnnotationDbi,genefilter,biomaRt、方法、并行
链接
建议	FDb.InfiniumMethylation.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	methylumi
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	methyAnalysis_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	methyAnalysis_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	methyAnalysis_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyAnalysis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methyAnalysis/
包下载报告	下载数据