安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“metavizr”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
这个包提供了Websocket沟通metaviz web应用程序(http://metaviz.cbcb.umd.edu)的宏基因组数据的交互式可视化。R / bioc交互式会话中的对象可以显示在情节和数据可以探索使用facetzoom可视化。支持基本Bioconductor数据结构(例如,MRexperiment对象),同时提供一个简单的机制来支持其他数据结构。可视化(使用d3.js)可以很容易地添加到web应用程序。
作者:赫克托耳Corrada布拉沃(cre, aut)弗罗林Chelaru (aut),贾斯汀·瓦格纳(aut) Jayaram Kancherla (aut),约瑟夫·保尔森(aut)
维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“metavizr”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“metavizr”)
HTML | R脚本 | 介绍metavizr |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GUI,基础设施,宏基因组,软件,可视化 |
版本 | 1.0.2中 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(0.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可 |
取决于 | R (> = 3.3),metagenomeSeq(> = 1.17.1)、方法data.table,Biobase,消化 |
进口 | epivizr,epivizrData,epivizrServer,epivizrStandalone,素食主义者,GenomeInfoDb,phyloseq,httr |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle,matrixStats,msd16s(> = 0.109.1),etec16s,testthat,gss |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | metavizr_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | metavizr_1.0.2.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | metavizr_1.0.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavizr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metavizr/ |
包下载报告 | 下载数据 |