要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("metaseqR")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

metaseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metaseqR

结合多种统计算法对RNA-Seq数据进行分析和结果报告的R包。

Bioconductor版本:Release (3.5)

为RNA-Seq基因表达数据提供了几个标准化和统计测试包的接口。此外,它创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行荟萃分析,并以互动的方式报告结果。

作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr b>

维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>

引用(来自R,输入引用(“metaseqR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("metaseqR")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“metaseqR”)

PDF R脚本 使用metaseqR的多种统计算法进行RNA-Seq数据分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression归一化预处理质量控制RNASeqReportWriting软件WorkflowStep
版本 1.16.0
在Bioconductor中 BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 2.13.0),EDASeqDESeqlimmaqvalue
进口 刨边机NOISeqbaySeqNBPSeqbiomaRt跑龙套,gplotscorrplotvsn酿造rjsonlog4r
链接
建议 BiocGenericsGenomicRangesrtracklayerRsamtoolssurvcomp维恩图knitr动物园RUnitBiocInstallerBSgenomeRSQLite
SystemRequirements
增强了 平行,移行细胞癌RMySQL
URL http://www.fleming.gr
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 metaseqR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 metaseqR_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) metaseqR_1.16.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/
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