要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("metaseqR")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
Bioconductor版本:Release (3.5)
为RNA-Seq基因表达数据提供了几个标准化和统计测试包的接口。此外,它创建了几个诊断图,通过结合几个统计测试的结果进行荟萃分析,并以互动的方式报告结果。
作者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr b>
维护者:Panagiotis Moulos < Moulos at fleming.gr>
引用(来自R,输入引用(“metaseqR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("metaseqR")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“metaseqR”)
R脚本 | 使用metaseqR的多种统计算法进行RNA-Seq数据分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,ReportWriting,软件,WorkflowStep |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 2.13.0),EDASeq,DESeq,limma,qvalue |
进口 | 刨边机,NOISeq,baySeq,NBPSeq,biomaRt跑龙套,gplots,corrplot,vsn,酿造,rjson,log4r |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,GenomicRanges,rtracklayer,Rsamtools,survcomp,维恩图,knitr,动物园,RUnit,BiocInstaller,BSgenome,RSQLite |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行,移行细胞癌,RMySQL |
URL | http://www.fleming.gr |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | metaseqR_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | metaseqR_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | metaseqR_1.16.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/metaseqR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metaseqR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |