要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metagenomeFeatures”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
metagenomeFeatures被开发用于探索标记基因宏基因组序列数据集的分类注释。该包可用于探索标记基因数据库的分类学组成或标记基因宏基因组实验中的注释序列。
作者:Nathan D. Olson, Joseph Nathaniel Paulson, Hector Corrada Bravo
维护者:Nathan D. Olson
引文(从R内,输入引用(“metagenomeFeatures”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“metagenomeFeatures”)
超文本标记语言 | R脚本 | 例16S标注流程 |
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,宏基因组,微生物组,测序,软件 |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4),Biobase(> = 2.17.8) |
进口 | Biostrings(> = 2.36.4),ShortRead(> = 1.26.0),dplyr(> = 0.7.0),dbplyr(> = 1.0.0),stringr(> = 1.0.0),lazyeval(> = 0.1.10),RSQLite(> = 1.0.0),magrittr(>= 1.5),方法(>= 3.3.1),晶格(> = 0.20.33),metagenomeSeq(> = 1.14.2),猿(> = 3.5),purrr(> = 0.2.2) |
链接 | |
建议 | knitr(> = 1.11),msd16s(> = 0.102.0),testthat(> = 0.10.0),rmarkdown(> = 1.3) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/HCBravoLab/metagenomeFeatures |
BugReports | https://github.com/HCBravoLab/metagenomeFeatures/issues |
全靠我 | |
进口我 | greengenes13.5MgDb |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | metagenomeFeatures_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | metagenomeFeatures_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | metagenomeFeatures_1.8.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metagenomeFeatures |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metagenomeFeatures/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |