要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagene”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

metagene

doi:10.18129/b9.bioc.metagene

生产metagene地块的包装

生物导体版本:版本(3.5)

该软件包产生了元原子图,以比较选定基因/特征组的DNA相互作用蛋白的行为。BAM文件用于增加分辨率。可以在单个分析中比较一组BAM文件和/或基因组区域组的多重组合。Bootstraping分析用于比较各组并找到具有统计学上不同富集曲线的区域。

作者:Charles Joly Beauparlant ,Fabien Claude Lamaze ,Rawane samb 在ulaval.ca>deschenes 的deschenes和arnaud droit

维护者:Charles Joly Beauparlant

引用(从r内,输入引用(“ metagene”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ metagene”)

文档

html R脚本 Metagene简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结盟,,,,chipseq,,,,覆盖范围,,,,遗传学,,,,多重组合,,,,测序,,,,软件
版本 2.8.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3年)
执照 Artistic-2.0 |文件许可证
要看 r(> = 3.2.0),R6(> = 2.0),基因组机,,,,生物比较
进口 rtracklayer,,,,GPLOTS, 工具,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,GenomicFeatures,,,,iranges,,,,GGPLOT2,,,,必须,,,,rsamtools,,,,dbchip,,,,矩阵
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,相似
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/charlesjb/metagene/issues
取决于我 输铁烯
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 metagene_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 metagene_2.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) metagene_2.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metagene
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/metagene/
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