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网眼

doi:10.18129/b9.bioc.meshes

网格丰富和语义分析

生物导体版本:版本(3.5)

网格(医学主题标题)是用于手动索引Medline/PubMed索引文章的NLM受控词汇。网格术语与Entrez基因ID相关联,三种方法Gendoo,Gene2pubmed和RBBH。该关联对于富集和语义分析至关重要。网格支持基因列表或整个表达谱的富集分析(过度占代表和基因集富集分析)。网格术语的语义比较提供了计算基因和基因组之间相似性的定量方法。网格分别实施了Resnik,Schlicker,Jiang,Lin和Wang提出的五种方法,并支持70多种。

作者:广琴Yu [AUT,CRE]

维护者:gmail.com> guangchuang yu

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安装

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文档

html R脚本 网眼介绍
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文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,聚类,,,,多重组合,,,,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(1年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.1),剂量(> = 2.11.7)
进口 AnnotationDbi,,,,Gosemsim(> = 1.99.3),网格, 方法,rvcheck
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,mesh.cel.eg.db,,,,mesh.hsa.eg.db
系统要求
增强
URL https://guangchuangyu.github.io/meshes
BugReports https://github.com/guangchuangyu/meshes/issues
取决于我
进口我
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源包 meshes_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 meshes_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) meshes_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/meshes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/meshes/
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