要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

基因组级网格布局

Bioconductor版本:Release (3.5)

基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别,以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别,并在图中添加自定义的图形。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

引文(从R内,输入引用(“gtrellis”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“gtrellis”)

文档

超文本标记语言 R脚本 制作基因组级别的格子图
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 测序软件可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.1.2),网格,IRangesGenomicRanges
进口 circlize(> = 0.3.3),GetoptLong, grDevices, utils
链接
建议 testthat(> = 1.0.0),knitrRColorBrewer减价ComplexHeatmap(> = 1.9.7),开罗pngjpegtiff
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/gtrellis
全靠我
进口我 YAPSA
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 gtrellis_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 gtrellis_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) gtrellis_1.8.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
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