安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“groHMM”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
Bioconductor版本:版本(3.5)
管道GRO-seq数据的分析。
作者:查尔斯·g·丹科米崔,安德烈•马丁斯w·李·克劳斯
维护人员:Anusha Nagari < Anusha。nagari utsouthwestern.edu >, Venkat Malladi <引导。malladi utsouthwestern.edu >,郁金香Nandu <郁金香。nandu utsouthwestern.edu >, w·李·克劳斯< lee.kraus utsouthwestern.edu >
从内部引用(R,回车引用(“groHMM”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“groHMM”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“groHMM”)
R脚本 | groHMM教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 测序,软件 |
版本 | 1.10.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(3年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.0.2),质量平行,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 2.5.27),GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.23.16),GenomicAlignments,rtracklayer |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,GenomicFeatures,刨边机,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM |
BugReports | https://github.com/Kraus-Lab/groHMM/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | groHMM_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | groHMM_1.10.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | groHMM_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/groHMM |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/groHMM/ |
包下载报告 | 下载数据 |