要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeeval”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Genotypeeval

doi:10.18129/b9.bioc.genotypeeval

GVCF或VCF文件的QA/QC

生物导体版本:版本(3.5)

使用GVCF或VCF并报告指标以评估呼叫质量。

作者:詹妮弗·汤姆[AUT,CRE]

维护者:jennifer tom

引用(从r内,输入引用(“ Genotypeeval”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genotypeypeeeval”)

文档

html genotypeeval_vignette.html
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 批处理效应,,,,DataImport,,,,遗传学,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,变体
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(2年)
执照 文件许可证
要看 r(> = 3.3.0),变体
进口 GGPLOT2,,,,rtracklayer,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges, 方法,生物比较,,,,RTSNE,图形,统计
链接
建议 rmarkDown,,,,测试,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 genotypeeval_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 genotypeeval_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) genotypeeval_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genotypeeval
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genotypeeval/
软件包下载报告 下载统计

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