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DOI：10.18129 / b9.bioc.genefilter

Genefilter：从高通量实验过滤基因的方法

Bioconductor版本：释放（3.5）

过滤基因的一些基本功能

作者：R. Gentleman，V. Carey，W. Huber，F. Hahne

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

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文件

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Browsevignettes（“Genefilter”）

PDF.	r script.	额外的图表：独立过滤增加了检测差异表达基因的功率，Bourgon等人，PNA（2010）
PDF.	r script.	独立筛选的诊断
PDF.	r script.	如何查找其表达概况与指定基因类似的基因
PDF.	r script.	使用GeneFilter函数从微阵列数据集中过滤基因
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	微阵列那软件
版本	1.58.1.
在生物导体中以来	BIOC 1.6（R-2.1）或更早（> 12.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠
进口	S4Vectors.（> = 0.9.42），annotationdbi.那注释那BioBase.，图形，方法，统计数据，生存
链接到
建议	班级那hgu95av2.db.那TKWidgets.那全部那鹏那DESEQ.那帕西拉那生物焦那kn
系统要求
加强
URL.
取决于我	A4Base.那AmpliqueSo.那cellhts2.那魅力那cntools.那Genemeta.那hiiragi2013那simpleaff.那SISPA.那SVA.
进口我	affyqcreport.那annmap.那ArrayqualityMetrics.那类别那Covrna那DESEQ.那deseq2.那Dexseq.那艾莎那GCMAP.那GGBase.那GISPA.那GSRI.那ihwpaper.那JunctionSeq.那甲烷分析那弥撒那Minfi.那ml interfaces那沼泽那pcaexplorer.那佩奇那现象那林诺那rnainteractmapk.那simpleaff.那tcgabiolinks.那t那XDE.
建议我	yeasyExpress.那注释那ArrayTools.那Bioccasestudies.那二乙衫那CompoundationCompare.那Clusterstab.那Codelink.那Compcoder.那CutatedBladderData.那CutatedCrcdata.那Cutatedovarardata.那delayedarray那factdesign.那FFPE.那ffpeexampledata.那Gagetata.那genogam.那基因组夫妇那古司裤那GSAR.那GSEALM那GSVA.那Logicfs.那lumi.那MAQCSUBSET.那mcrestimate那NPGSEA.那oligo.那onechannelgui.那文学那PVAC.那QPGraph..那林葛普查组织那RheumaticConditionWollbold.那rtracklayer.那siggenes.那single.mtec.transcriptomes.那SSPA.那顶点那XDE.
建立报告

包档案包

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源包	genefilter_1.58.1.tar.gz.
Windows二进制文件	Genefilter_1.58.1.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	Genefilter_1.58.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genefilter
包短网址	http://biocidodder.org/packages/genefilter/
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