安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“gCrisprTools”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

gCrisprTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.gCrisprTools

套功能汇集Crispr屏幕质量控制和分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

的工具集来评估集中大规模筛选实验中,通常采用CRISPR磁带/ Cas9或成分表达式。包含的方法询问图书馆和磁带的行为在一个实验中,确定不同的丰富的磁带,聚合信号识别候选目标的实证验证,假设检验和全面的报告。

作者:拉塞尔•贝恩Dariusz Ratman皮特·哈,史蒂夫Lianoglou

维修工:拉塞尔·贝恩<哈。彼得在gene.com >

从内部引用(R,回车引用(“gCrisprTools”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“gCrisprTools”)

文档

HTML R脚本 Example_Workflow_gCrisprTools
HTML R脚本 gCrisprTools_Vignette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiomedicalInformatics,CRISPR,CellBiology,DifferentialExpression,ExperimentalDesign,FunctionalGenomics,GeneSetEnrichment,遗传学,MultipleComparison,归一化,遗传药理学,药物基因组学,PooledScreens,预处理,质量控制,RNASeq,回归,软件,SystemsBiology,可视化
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3)
进口 Biobase,limma,RobustRankAggreg,ggplot2,PANTHER.db,rmarkdowngrDevices图形,统计,跑龙套,平行
链接
建议 刨边机,knitr、网格AnnotationDbi,org.Mm.eg.db,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics
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包档案

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源包 gCrisprTools_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 gCrisprTools_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) gCrisprTools_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gCrisprTools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gCrisprTools/
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