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DOI:10.18129 / B9.bioc.fgsea

快速基因集富集分析

Bioconductor版本:Release (3.5)

该软件包实现了快速基因集富集分析的算法。使用快速算法可以进行更多的排列，并获得更细粒度的p值，这允许使用准确的标准方法进行多个假设修正。

作者:Alexey Sergushichev [aut, cre]

维护人员:Alexey Sergushichev

安装

要安装这个包，启动R并输入:

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文档

超文本标记语言	R脚本	使用fgsea包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，通路，软件
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.3)，Rcpp
进口	data.table，BiocParallel统计数据,ggplot2(> = 2.2.0),gridExtra、网格fastmatch
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，rmarkdown，reactome.db，AnnotationDbi、并行
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/ctlab/fgsea/
BugReports	https://github.com/ctlab/fgsea/issues
全靠我	PPInfer
进口我	剂量，钢琴
建议我	π
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	fgsea_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	fgsea_1.2.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	fgsea_1.2.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fgsea
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/fgsea/
软件包下载报告	下载数据