要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“esetVis”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

expressionSet Bioconductor对象的可视化

Bioconductor版本:Release (3.5)

用于expressionSet(或summarizeexperiment)生物导体对象可视化的实用函数,包括谱图、tsne和线性判别分析。可以通过ggplot2包进行静态绘图,也可以通过ggvis或rbokeh包进行交互式绘图。

作者:Laure counnaud < Laure。Cougnaud在openanalytics.eu>

维护者:Laure counnaud < Laure。Cougnaud在openanalytics.eu>

引文(从R内,输入引用(“esetVis”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“esetVis”)

文档

超文本标记语言 R脚本 esetVis包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentationDimensionReduction通路PrincipalComponent软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(1年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 mpmhexbinRtsne中长期规划、网格Biobase质量,统计,utils, grDevices
链接
建议 ggplot2ggvisrbokehggrepelknitrrmarkdown所有hgu95av2.dbAnnotationDbi老鸨SummarizedExperiment
SystemRequirements
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URL
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 esetVis_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 esetVis_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) esetVis_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/
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