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DOI:10.18129 / B9.bioc.epigenomix

表观遗传和基因转录数据的归一化和混合模型的集成

Bioconductor版本:Release (3.5)

通过ChIP-seq获得的基于RNA-seq或微阵列的基因转录和组蛋白修饰数据的综合分析包。该软件包提供了数据预处理和匹配的方法，以及贝叶斯混合模型的拟合方法，以检测两种数据类型存在差异的基因。

作者:Hans-Ulrich Klein, Martin Schaefer

维护人员:Hans-Ulrich Klein

安装

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文档

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browseVignettes(“epigenomix”)

PDF	R脚本	表观基因组合包小插图
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，分类，DifferentialExpression，GeneExpression，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(4.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(>= 3.2.0)，方法，Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment
进口	BiocGenerics，MCMCpack，Rsamtools平行,GenomeInfoDb，beadarray
链接
建议
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增强了
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全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	epigenomix_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	epigenomix_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	epigenomix_1.16.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epigenomix
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epigenomix/
软件包下载报告	下载数据