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eisa

DOI:10.18129 / B9.bioc.eisa

通过迭代签名算法表达数据分析

Bioconductor版本:版本(3.5)

迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。

作者:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

维护人员:伽柏Csardi < Csardi。伽柏gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(eisa)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (eisa)

文档

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browseVignettes (eisa)

PDF R脚本 基因表达数据的迭代签名算法
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 2.6 (r - 2.11)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法
进口 BiocGenerics,类别,genefilter,DBI
链接
建议 igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 ExpressionView
进口我 ExpressionView
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 eisa_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 eisa_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) eisa_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
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