要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“edge”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
Bioconductor版本:Release (3.5)
边缘包实现了用于进行全基因组基因表达研究的差异表达分析的方法。使用最佳发现程序和广义似然比检验(相当于f检验和t检验)对一般研究设计进行显著性检验。特殊功能可用于方便分析常见的研究设计,包括时间课程实验。edge还集成了其他包,如snm、sva和qvalue,为基因表达分析提供了广泛的工具。
作者:John D. Storey, Jeffrey T. Leek和Andrew J. Bass
维护者:John D. Storey
引文(从R内,输入引用(“边缘”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“edge”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“边缘”)
R脚本 | 包边 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,回归,软件,TimeCourse |
版本 | 2.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(2.5年) |
许可证 | MIT +文件许可 |
取决于 | R (>= 3.1.0),Biobase |
进口 | 方法、样条函数股东价值分析,球形结构,稻草人,qvalue(> = 1.99.0),质量 |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,ggplot2,reshape2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/jdstorey/edge |
BugReports | https://github.com/jdstorey/edge/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | edge_2.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | edge_2.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | edge_2.8.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/edge/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |