要安装此软件包，请启动R并输入：
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在大多数情况下，您根本不需要下载包装存档。
德芬德
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doi：10.18129/b9.bioc.derfinder
通过DER FINDER方法对RNA-SEQ数据的注释 - 无形差分表达分析分析
生物导体版本：版本（3.5）
该软件包提供了RNA-Seq数据的注释 - 敏捷差分表达分析的功能。此软件包中包括了DER Finder方法的两个实现：（1）在表达区域级别的单个基础级F统计数据和（2）DER标识。DER Finder方法也可以用于识别差异界限的芯片seq峰。
作者：Leonardo Collado-Torres [AUT，CRE]，Alyssa C. Frazee [CTB]，Andrew E. Jaffe [aut]，Jeffrey T. Leek [Aut，THS]
维护者：leonardo collado-torres
引用（从r内，输入引用（“ derfinder”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ derfinder”）
文档
| html | R脚本 | Derfinder快速入门指南 |
| html | R脚本 | Derfinder用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异性，，，，差异词，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.10.6 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.2） |
| 进口 | AnnotationDbi（> = 1.27.9），生物比较，，，，Bumphunter（> = 1.9.2），derfinderhelper（> = 1.1.0），GenomeInfodB（> = 1.3.3），基因组签名，，，，GenomicFeatures，，，，Genomicfiles，，，，基因组机（> = 1.17.40），HMISC，，，，iranges（> = 2.3.23），方法，QVALUE（> = 1.99.0），rsamtools（> = 1.25.0），rtracklayer，，，，S4VECTORS（> = 0.9.38） |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用（> = 2.3.12），Biovizbase，，，，DevTools（> = 1.6），derfinderdata（> = 0.99.0），derfinderplot，，，，deseq2，，，，GGPLOT2，，，，编织（> = 1.0.1），尼特（> = 1.6），林玛，，，，Refmanager，，，，rmarkDown（> = 0.3.3），测试，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/lcolladotor/derfinder |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/derfinder/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | derfinderplot，，，，叙事，，，，地区报告 |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | derfinder_1.10.6.tar.gz |
| Windows二进制 | derfinder_1.10.6.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | derfinder_1.10.6.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
