要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ddgraph”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

ddgraph

doi:10.18129/b9.bioc.ddgraph

区分与图形建模的直接和间接相互作用

生物导体版本:版本(3.5)

区分基因调节中的间接相互作用,并推断组合代码与高度相关的变量(例如转录因子结合曲线)。该软件包实现了邻域一致的PC算法(NCPC),并绘制直接依赖图以表示目标变量周围的依赖性结构。该软件包还提供了其他图形建模(贝叶斯网络)软件包的统一接口,以区分直接和间接交互。

作者:罗伯特·斯托吉尼克(Robert Stojnic)

维护者:robert stojnic

引用(从r内,输入引用(“ ddgraph”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ ddgraph”)

PDF R脚本 “ DDGRAPH”软件包的概述
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 GraphandNetwork,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(5年)
执照 GPL-3
要看 图形, 方法,RCPP
进口 Bnlearn(> = 2.8),gtools,,,,PCALG,,,,rcolorbrewer,,,,plotrix,,,,大量的
链接 RCPP
建议 rgraphviz,,,,E1071,,,,rocr,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ddgraph_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 ddgraph_1.20.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) ddgraph_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddgraph
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ddgraph/
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