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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddCt”)
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Bioconductor版本:Release (3.5)
Delta-Delta-Ct (ddCt)算法是一种通过定量实时荧光定量PCR (qRT-PCR)实验来确定相关基因表达的近似方法。与其他方法相比,该方法不需要每个引物-目标对的标准曲线,因此减少了工作负荷,但只要放大效率的假设成立,就能返回足够准确的结果。ddCt包实现了一个收集、分析和可视化qRT-PCR结果的管道,例如那些来自TaqMan SDM软件的结果,主要使用ddCt方法。管道可以通过命令行脚本调用,也可以通过由s4 -类、方法和函数组成的API调用。
作者:张季涛,鲁道夫·比佐克,马库斯·鲁斯肖普特
维护者:Jitao David Zhang
引文(从R内,输入引用(ddCt)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ddCt”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (ddCt)
R脚本 | 使用ddCt包中的端到端脚本分析RT-PCR数据 | |
R脚本 | 如何应用ddCt方法 | |
R脚本 | 介绍用于qRT-PCR数据分析的ddCt方法:背景、算法和实例 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,MicrotitrePlateAssay,软件,qPCR |
版本 | 1.32.0 |
在Bioconductor | BioC 2.5 (R-2.10)(8年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R(>= 2.3.0),方法 |
进口 | Biobase(> = 1.10.0),RColorBrewer(> = 0.1 3),xtable,晶格,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ddCt_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | ddCt_1.32.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ddCt_1.32.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddCt |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ddCt/ |
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