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DOI:10.18129 / B9.bioc.dSimer

集成相似疾病的方法

Bioconductor版本:版本(3.5)

dSimer 9 R包提供计算方法测量disease-disease相似,包括一个标准的余弦相似性度量和八个基于函数的方法。疾病相似矩阵获得这九个方法可以通过热图可视化和网络。生物数据广泛用于disease-disease关联研究也由dSimer提供。

作者:李敏<港mail.csu.edu.cn >,彭倪< nipeng csu.edu.cn >黄来自范Zhihui和萍。

维护人员:彭倪< nipeng csu.edu.cn >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

HTML	R脚本	集成相似疾病的方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络,软件,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3.0),igraph(> = 1.0.1)
进口	统计数据,Rcpp(> = 0.11.3),ggplot2,reshape2,GO.db,org.Hs.eg.db,AnnotationDbi、图形
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	dSimer_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	dSimer_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	dSimer_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dSimer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dSimer/
包下载报告	下载数据