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Cosmiq

doi:10.18129/b9.bioc.cosmiq

COSMIQ-将单个质量合并为数量

生物导体版本:版本(3.5)

COSMIQ是用于预处理液态或气相色谱质谱法(LCMS/GCMS)数据的工具,重点是代谢组学或脂质组学应用程序。为了改善低丰富信号的检测,COSMIQ在应用峰值检测算法之前从所有获得的运行中生成MZ/RT空间的主图。结果是,与在每个LCMS/GCMS文件中执行峰值拾取的传统方法相比,低强度MS信号的更强大识别和量化。COSMIQ软件包构建在XCMSSET对象结构上,因此可以与软件包XCMS良好集成为替代预处理步骤。

作者:David Fischer ,Christian Panse ,endre laczko

维护者:googlemail.com上的David Fischer ,Christian Panse

引用(从r内,输入引用(“ Cosmiq”)):

安装

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文档

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PDF R脚本 Cosmiq底漆
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(3年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.0.2),RCPP
进口 pracma,,,,XCMS,,,,MassSpececebeet,,,,法阿科
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
取决于我
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源包 cosmiq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 cosmiq_1.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) cosmiq_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/
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