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DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT

提高早期使用Strand-Seq数据构建基因组装配

Bioconductor版本:版本(3.5)

使用链继承数据从多个单个细胞的生物基因组组装,contiBAIT一起尚留有未架起桥梁集群重叠群成公认的染色体,和秩序的重叠群在这些染色体。

作者:基兰奥尼尔,马克山,迈克戈特利布

维护人员:基兰奥尼尔< koneill在bccrc.ca >

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PDF	R脚本	flowBi
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,遗传学,GenomeAssembly,质量控制,软件,WholeGenome
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(1.5年)
许可证	BSD_2_clause +文件许可
取决于	黑洞(> = 1.51.0-3),Rsamtools(> = 1.21)
进口	grDevices,线索,集群,gplots,IRanges,GenomicRanges,S4Vectors,Rcpp,茶匙,GenomicFiles,gtools,rtracklayer,BiocParallel,DNAcopy,色彩,reshape2,ggplot2、方法、exomeCopy,GenomicAlignments,图
链接	Rcpp,黑洞
建议	BiocStyle
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	contiBAIT_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	contiBAIT_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	contiBAIT_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/contiBAIT/
包下载报告	下载数据