##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("compcodeR")

DOI:10.18129 / B9.bioc.compcodeR

RNAseq数据仿真、差分表达式分析及差分表达式方法性能比较

Bioconductor版本:Release (3.5)

这个包提供了广泛的功能，用于比较RNAseq数据的差异表达式分析的不同方法所获得的结果。它还包含用于模拟计数数据的函数和用于执行差异表达式分析的多个包的接口。

作者:夏洛特Soneson

维护人员:Charlotte Soneson

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("compcodeR")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“compcodeR”)

PDF	R脚本	compcodeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，RNASeq，软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (R-3.1)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.2),sm
进口	tcltk,knitr(> = 1.2),减价，ROCR，晶格(> = 0.16),gplots，gtools，gdata，caTools、网格KernSmooth，质量，ggplot2，stringr，模式，刨边机，limma，vioplot、方法
链接
建议	BiocStyle，EBSeq，DESeq，DESeq2(> = 1.1.31),baySeq(> = 2.2.0),genefilter，NOISeq，移行细胞癌，samr，NBPSeq(> = 0.3.0)
SystemRequirements
增强了	rpanel，DSS
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	compcodeR_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	compcodeR_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	compcodeR_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compcodeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/compcodeR/
包下载报告	下载数据